曇花更換盆栽的最佳時期應選擇在春季。此時氣候適宜，溫度大約在12攝氏度左右。最好在曇花發芽之前進行更換盆栽，以減小對植物生長的影響。如果在極端天氣下進行更換，會對植株造成較大的危害，并延長苗期時間。在曇花幼苗時期，一般每年更換一次盆栽；而在成形株時期，每兩到三年更換一次盆栽。

更換盆栽時應輕拿輕放，避免對根部造成損傷，或直接帶著土壤更換。新土壤應選擇透氣性好的，最好提前進行消毒，以避免土壤中出現病菌對植株的侵害，從而有利于后期的養護。

更換盆栽之后的苗期大約持續一周。在此期間，應將植物放置在陰涼通風處，并適當補充水分。在補充水分時應控制水量，只需保持土壤稍濕即可，過多的水量反而無法吸收。苗期結束后，當穩定生長后，就可以正常進行養護了。另外，苗期期間不宜施肥，并避免陽光直曬。