水培養殖君子蘭時水的選擇非常關鍵，不能直接使用自來水。可以將自來水裝入透明容器中，暴曬在陽光下，以使水中的雜質沉淀。水的顏色轉變為綠色較為理想。處理過濾后的水后，水位要適中，太高會導致君子蘭的假鱗莖被淹沒，導致腐爛；太淺則會影響充足的水分供應。

水質也是水培君子蘭時需要注意的重要因素，水質差會對君子蘭的生長不利，同時也會缺乏氧氣和肥料。因此，需要定期更換水。此外，長時間水培會出現青苔，影響根部呼吸，需定時輕刷除去。另外，還需經常檢查水培容器中是否含有足夠的氧氣。簡單的方法是放入幾條小魚觀察其活動情況，如果小魚總是浮出水面，則說明氧氣不足，需要及時補充氧氣。

此外，保持適宜的水溫也是水培時的重要注意事項，這樣植株才能正常生長。