市場上銷售的彩色玉米大多是雜交品種，而非經過基因改造的品種。彩色玉米相對于普通玉米，在營養成分方面更加豐富，適合直接食用或者進行加工。彩色玉米的品種包括印度紅玫瑰爆裂玉米、巴西五彩玉米、泰國花仙子玉米、韓國紫金香黑玉米、日本白如雪甜糯玉米以及美國七彩琉璃玉米。此外，當本地玉米與黑玉米或黃白玉米自然雜交后，也可能出現花玉米品種。