南京有許多專科院校，包括南京森林公安高等專科學校、南京動力高等專科學校、南京金融高等專科學校、南京電力高等專科學校等等。此外，還有江蘇省省級機關管理干部學院、南京市航務工程專科學校、南京鐵道職業技術學院、江蘇海事職業技術學院、江蘇省基督教圣經專科學校、南京交通高等專科學校以及南京市農業專科學校、南京師范專科學校、南京市中等師范專科學校、南京航務工程專科學校等等。同時，還有南京森林公安職業技術學院、南京工業職業技術學院、南京信息職業技術學院等等。