第三次忍界大戰的情節在《火影忍者》中被描繪為回憶片段，只有少許閃回的片段，而真正的戰斗場面是在第339話首次出現。

這次戰爭是《火影忍者》中的一個重要事件，起因是各大忍國與周邊小國和忍者村之間的戰爭。與此同時，五大忍者國在近十年的和平時期逐漸恢復了國力。

各大忍國為了自己的利益，采取了壓制、拉攏、滲透周邊小國的策略，并且相互爭奪大陸核心領土和資源。實際上，第三次忍界大戰是第二次忍界大戰的延續。

這次戰爭與之后發生的第四次忍界大戰有著密切的聯系，可以說第三次忍界大戰的影響開啟了整個《火影忍者》疾風傳的主線故事。