發酵黑蒜具有良好的殺菌功能，可在腸道傳染流行期間每天食用1~2顆生黑蒜，預防腸道傳染病的發生，有效避免腹瀉。此外，經常食用發酵黑蒜還能夠抑制和殺滅腸道有害菌。不僅如此，發酵黑蒜還可作為一種外用藥物來治療多種疾病，例如可以用于止鼻血。只需將生黑蒜搗爛后敷在腳心上，如果左鼻孔流血則敷在右腳心上，反之亦然，很快就能止血。一項動物研究表明，每天食用2顆發酵黑蒜可遠離疾病，特別是原發性肺動脈高壓，這是造成心臟衰竭的主要原因之一。原發性肺動脈高壓使得血液難以流入右側心臟，這是由于肺部的血管過于緊縮所致，其癥狀包括呼吸困難、運動時的胸痛和暫時性暈眩。然而，研究顯示發酵黑蒜可以預防原發性肺動脈高壓的發生。