在銀行或其他金融機構申請貸款或存款時，百分之五的年利率是根據本金來計算的。具體計算方法如下：假設小明在銀行存入了10000元，存款期限為1年，年利率為5%。根據這個利率，他的存款將會產生500元的利息。當存款期限到達時，小明可以取回本金和利息，總額為10500元。值得注意的是，具體的存款或貸款利率將根據銀行規定的利率來確定。